30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09553 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  30.25 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  28.86 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  26.6 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06025  lipoprotein, putative  25.98 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  25.44 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  25.89 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  26.13 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  26.78 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  26.78 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  24.31 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  24.57 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  24.9 
 
 
222 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  23.39 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  23.35 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  22.84 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  22.49 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  22.84 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  18.92 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  21.56 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  21.03 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  18.81 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0100  hypothetical protein  25.41 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  21.16 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  20.85 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  19.83 
 
 
301 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  19.62 
 
 
233 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>