21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1200 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  30.97 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  25.1 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  26.6 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.31 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  25.63 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  26.84 
 
 		 847 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  27.36 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  27.55 
 
 		 847 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  26.32 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  26.94 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  25.88 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06025  lipoprotein, putative  23 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  25.24 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  22.38 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  24.12 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  24.41 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>