47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6213 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  35.37 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  32.2 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  32.34 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  30.23 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  30.83 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  31.76 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  32.71 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  31.03 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  30.23 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  31.8 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  30.37 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  28.16 
 
 		 301 aa  88.6  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  28.77 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.57 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  26.44 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  25.79 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  25.51 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  26.13 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  26.02 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  25.63 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  21.58 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  24.68 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  27.47 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  23.12 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  24.04 
 
 		 847 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  28.28 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  22.27 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0198  hypothetical protein  25.73 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  22.18 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  23.53 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  22.73 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  22.75 
 
 		 847 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  24.29 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  21.78 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  26.6 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  26.56 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  22.87 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>