38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2367 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  88.31 
 
 
231 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  88.21 
 
 
231 aa  363  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  32.24 
 
 
239 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  28.9 
 
 
240 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  31.36 
 
 
235 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  29.75 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  30.57 
 
 
251 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  28.63 
 
 
244 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  29.49 
 
 
285 aa  88.6  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  27.04 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  26.61 
 
 
228 aa  85.5  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  29.38 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  28.85 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  25.73 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  25.73 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  27.36 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  25.95 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  37.09 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  27.78 
 
 
847 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  28.37 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  33.66 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  25.22 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  23.9 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  21.84 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  30.94 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  32.35 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  22.71 
 
 
240 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  22.38 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  23.83 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  22.48 
 
 
231 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  31.33 
 
 
334 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  39.77 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  39.77 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  39.77 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  39.77 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  27.08 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>