32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1005 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  27.35 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  29.82 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  31.88 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  30.22 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  27.14 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  28.11 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  28.09 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  27.18 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  26.21 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  30.19 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  24.73 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  26.29 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  24.68 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  23.9 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  26.29 
 
 
228 aa  58.9  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  26.49 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  25.82 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  22.69 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  23.39 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  25.98 
 
 
847 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  22.01 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4363  hypothetical protein  28.44 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0373476  normal  0.295669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  24.48 
 
 
847 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  22.27 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  21.81 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  26.04 
 
 
294 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  24.19 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  20.43 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  22.46 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  24.41 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>