40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6853 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  34.44 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  37.71 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  33.9 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  37.84 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  31.87 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  31.49 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  32.71 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  32.24 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  32.71 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  29.34 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  29.05 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  28.31 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  27.62 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  24.78 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  24.41 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  25.81 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  25.44 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  30 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  25.11 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.12 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  35.24 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  36.79 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  22.59 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  30.28 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  23.65 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  20.96 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06025  lipoprotein, putative  23.21 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  22.77 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  21.08 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  28.44 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  31.25 
 
 		 233 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>