36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4449 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  44.44 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  28.44 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  41.67 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  32.06 
 
 		 250 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  26.61 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  33.96 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  34.91 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  31.43 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  34.17 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  32.76 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  30.83 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  46.24 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  26.67 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  29.86 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2487  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4897  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307002  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  31.58 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  23.01 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  23.08 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  25.86 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  31.71 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  30.28 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  27.78 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  23.58 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>