38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1151 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  33.62 
 
 		 235 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  34.32 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  32.64 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  31.49 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  33.48 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  30.22 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  30.37 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  29.86 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  29.18 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  30.19 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  29.18 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  24.9 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  26.7 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  29.73 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.27 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  23.11 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  22.41 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  24.15 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  38.32 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  24.39 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  23.67 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  37.62 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  23.08 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  30.47 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  27.71 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  31.01 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  27.32 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  26.27 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  29.76 
 
 		 847 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>