14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1828 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  34.62 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  32.94 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  27.43 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  27.84 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  30.61 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  28.39 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  32.32 
 
 		 308 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  25.98 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  25 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  27.64 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03655  hypothetical protein  21.6 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  26.27 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>