17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0893 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  29.91 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  26.97 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  23.23 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  26.13 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  22.77 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  23.63 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  22.32 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  22.32 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  23.48 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  23.27 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  21.88 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  23.04 
 
 		 847 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  38.81 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03655  hypothetical protein  21.48 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>