26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0014 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  520  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  80.68 
 
 		 294 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  75 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.74 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  25.65 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  25.65 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  31.51 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  23.91 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  28.39 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  26.8 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  25.13 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  22.96 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  23.85 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.59 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  23.21 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  26.19 
 
 		 847 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  23.72 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  20.63 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  23.66 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  21.34 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  18.35 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  23.33 
 
 		 847 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  22.32 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  19.55 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>