19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0015 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  100 
 
 		 264 aa  522  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  75 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  72.35 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.98 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  24.78 
 
 		 231 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  24.78 
 
 		 231 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  23.91 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  27.27 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  26.64 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  26.01 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.3 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  24.37 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  23.04 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  22.73 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  22.78 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  22.58 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  21.12 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  18.59 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>