More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2431 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  46.5 
 
 		 695 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  46.36 
 
 		 697 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  47.94 
 
 		 699 aa  670    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  48.5 
 
 		 695 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  45.77 
 
 		 725 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  59.21 
 
 		 728 aa  911    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  46.1 
 
 		 702 aa  646    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  46.21 
 
 		 714 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  47.58 
 
 		 721 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.84 
 
 		 727 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  47.54 
 
 		 714 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  46.5 
 
 		 695 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  48.83 
 
 		 734 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  47.12 
 
 		 712 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  47.76 
 
 		 718 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.27 
 
 		 722 aa  662    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  46.92 
 
 		 716 aa  661    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  63.92 
 
 		 724 aa  991    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  46.66 
 
 		 697 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 729 aa  1505    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  45.66 
 
 		 713 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  47.79 
 
 		 695 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.41 
 
 		 714 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  45.47 
 
 		 695 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  57.88 
 
 		 729 aa  874    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  58.71 
 
 		 723 aa  862    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  46.48 
 
 		 725 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  72.45 
 
 		 728 aa  1134    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  56.81 
 
 		 727 aa  854    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  46.18 
 
 		 723 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  47.16 
 
 		 697 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.03 
 
 		 705 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  48.57 
 
 		 701 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  58.94 
 
 		 732 aa  896    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  46.03 
 
 		 729 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  46.86 
 
 		 711 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  46.46 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  44.96 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  44.57 
 
 		 727 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  45.03 
 
 		 726 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  44.84 
 
 		 723 aa  628  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  45.3 
 
 		 696 aa  625  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  45.01 
 
 		 721 aa  628  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  45.82 
 
 		 717 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  43.76 
 
 		 722 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  44.89 
 
 		 733 aa  623  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  45.93 
 
 		 703 aa  623  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  44.57 
 
 		 723 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  45.39 
 
 		 706 aa  623  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  45.26 
 
 		 726 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  44.66 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  45.31 
 
 		 724 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  45.24 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  43.62 
 
 		 726 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  43.51 
 
 		 730 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  44.75 
 
 		 730 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  42.53 
 
 		 702 aa  581  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.32 
 
 		 699 aa  554  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.93 
 
 		 676 aa  503  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.39 
 
 		 688 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.2 
 
 		 688 aa  439  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  37.59 
 
 		 716 aa  408  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  33.59 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  29.8 
 
 		 448 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  29.5 
 
 		 474 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  35.66 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.3 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  38.16 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  32.89 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  34.74 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  27.49 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  38.75 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.11 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  28.86 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  38.75 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  38.75 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  30.93 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  30.93 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  30.93 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  39.02 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  34.48 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  31.65 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  30.93 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  28.26 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  27.45 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.18 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  33.33 
 
 		 476 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  30.93 
 
 		 471 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  30.93 
 
 		 454 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  36.14 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  36.14 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  36.14 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  30.16 
 
 		 443 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  36.14 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  34.52 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>