264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1203 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 497 aa  987    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  39.82 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  31.66 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  31.1 
 
 		 483 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  28.51 
 
 		 461 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  29.96 
 
 		 443 aa  169  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  27.24 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  29.05 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 455 aa  147  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.87 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 1496 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  24.67 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.82 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.64 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.28 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  20.49 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.64 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.2 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.62 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  19.82 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.95 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.06 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.6 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.46 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  23.32 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  21.4 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  25.25 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.81 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.18 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.36 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.18 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.6 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.67 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.23 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.52 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.47 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  22.05 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  23.87 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.96 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.08 
 
 		 576 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.36 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.4 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.91 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  26.26 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  20.71 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  25.15 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.32 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.75 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  22.75 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.92 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.89 
 
 		 586 aa  57  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  21.38 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.23 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.03 
 
 		 480 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.5 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.25 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  21.76 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.87 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  23.96 
 
 		 606 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.11 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.12 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.94 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.79 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  30 
 
 		 874 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 470 aa  53.9  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>