More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0745 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  100 
 
 		 1005 aa  2062    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  40.71 
 
 		 1014 aa  736    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  41.11 
 
 		 1010 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  38.44 
 
 		 1042 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  38.88 
 
 		 1042 aa  680    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  38.48 
 
 		 1040 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  38.81 
 
 		 1059 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  37.56 
 
 		 1031 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.81 
 
 		 1067 aa  268  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  26.14 
 
 		 1062 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  26.14 
 
 		 1062 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  26.11 
 
 		 1062 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  26.01 
 
 		 1062 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  26.12 
 
 		 1066 aa  249  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.72 
 
 		 1062 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.09 
 
 		 1065 aa  247  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  25.1 
 
 		 1049 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.59 
 
 		 1062 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.4 
 
 		 1062 aa  244  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.95 
 
 		 1081 aa  241  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  25.89 
 
 		 1069 aa  240  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.6 
 
 		 1062 aa  237  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.46 
 
 		 1060 aa  235  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1138 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.21 
 
 		 1071 aa  222  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  24.58 
 
 		 1052 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1062 aa  207  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1078 aa  202  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.47 
 
 		 1084 aa  193  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.61 
 
 		 1111 aa  188  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  24.46 
 
 		 1113 aa  181  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  29.45 
 
 		 686 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  31.25 
 
 		 445 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  26.42 
 
 		 680 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.67 
 
 		 426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.81 
 
 		 1097 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.52 
 
 		 1067 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.78 
 
 		 459 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.21 
 
 		 1125 aa  121  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.14 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  24.8 
 
 		 598 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.65 
 
 		 590 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.67 
 
 		 717 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  33.47 
 
 		 469 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.76 
 
 		 1090 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.89 
 
 		 445 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  24.49 
 
 		 1084 aa  111  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.11 
 
 		 438 aa  111  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 666 aa  111  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.91 
 
 		 478 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.84 
 
 		 1076 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.94 
 
 		 434 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.56 
 
 		 1082 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  26.53 
 
 		 484 aa  106  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  26.05 
 
 		 1167 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  35.03 
 
 		 445 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  31.7 
 
 		 430 aa  104  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  31.7 
 
 		 430 aa  104  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.05 
 
 		 590 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.26 
 
 		 437 aa  104  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.26 
 
 		 440 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  36.07 
 
 		 572 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.65 
 
 		 444 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  26.14 
 
 		 692 aa  101  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  33.71 
 
 		 450 aa  101  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  36.21 
 
 		 443 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.86 
 
 		 433 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  27.03 
 
 		 432 aa  100  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 969 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25.5 
 
 		 428 aa  99.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.32 
 
 		 435 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.31 
 
 		 567 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.78 
 
 		 450 aa  96.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.87 
 
 		 431 aa  96.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 442 aa  96.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.94 
 
 		 444 aa  96.3  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.9 
 
 		 428 aa  95.5  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.17 
 
 		 485 aa  95.9  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.15 
 
 		 456 aa  95.5  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.12 
 
 		 430 aa  95.1  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34 
 
 		 426 aa  94.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 434 aa  94.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  37.16 
 
 		 316 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  22 
 
 		 426 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.67 
 
 		 660 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.06 
 
 		 433 aa  93.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  25.34 
 
 		 490 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.73 
 
 		 441 aa  92.8  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 428 aa  92  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  25.35 
 
 		 424 aa  91.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  34.84 
 
 		 296 aa  91.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  39.32 
 
 		 982 aa  91.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.23 
 
 		 667 aa  91.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  24.21 
 
 		 672 aa  90.9  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.98 
 
 		 446 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 403 aa  90.5  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.55 
 
 		 433 aa  90.5  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.86 
 
 		 470 aa  90.5  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  25.64 
 
 		 417 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  25.64 
 
 		 417 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>