More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0105 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0105  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 339 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0592  anti-FecI sigma factor, FecR  39.4 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4716  anti-FecI sigma factor, FecR  38.32 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.482399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1219  anti-FecI sigma factor, FecR  40.8 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6285  anti-FecI sigma factor, FecR  39.1 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0641  anti-FecI sigma factor, FecR  39.56 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5656  anti-FecI sigma factor, FecR  33.72 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6449  anti-FecI sigma factor, FecR  31.34 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6467  anti-FecI sigma factor, FecR  30.09 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000025711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1096  anti-FecI sigma factor, FecR  28.63 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5329  anti-FecI sigma factor, FecR  31.1 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155161  normal  0.240283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5659  anti-FecI sigma factor, FecR  25.97 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0059  FecR protein  29.6 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6149  anti-FecI sigma factor, FecR  31.36 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.909787  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2436  anti-FecI sigma factor, FecR  27.08 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.862248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1624  anti-FecI sigma factor, FecR  26.74 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724045  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  30.21 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3389  anti-FecI sigma factor, FecR  30.3 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4790  anti-FecI sigma factor, FecR  23.44 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0252158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  34.44 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  28.29 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6759  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  31.03 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0305  anti-FecI sigma factor, FecR  27.19 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  27.7 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  28.05 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  27.09 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  27.76 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1846  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  26.62 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  32.99 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  24.64 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5485  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996805  normal  0.0475249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  25.69 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  27.11 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4012  FecR protein  23.63 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  30.57 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  28.57 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  32.78 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2263  anti-FecI sigma factor, FecR  25.41 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  25.75 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  26.24 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  24.44 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  31.15 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  32.37 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  24.72 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  25.97 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  27.87 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  31.02 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  32.4 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  28.57 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6566  anti-FecI sigma factor, FecR  29.09 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.636553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.45 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  30.32 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  28.45 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  32.54 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  30.92 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  29.76 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  31.79 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  26.98 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  31.12 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4170  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  25.61 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  29.48 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  31.05 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  26.69 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  30.84 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4980  anti-FecI sigma factor, FecR  24.06 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000984334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  29.61 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  29.58 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  27.72 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  29.7 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7235  anti-FecI sigma factor, FecR  24.82 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  26.92 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  30.57 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  29.7 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  29.53 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.21 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  27.17 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.18 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  29.7 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.13 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  28.45 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  29.41 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  30.59 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  26.87 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  28.81 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>