151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  100 
 
 		 271 aa  524  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  60.37 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  54.81 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  51.29 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  55.93 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  43.28 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  40.66 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.48 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  37.04 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  40.23 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  40.8 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  36.96 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  40.07 
 
 		 275 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.67 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  41.42 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  38.15 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  36.67 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  38.27 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.85 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  33.45 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  40.5 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  40.08 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.77 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  32.93 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.98 
 
 		 445 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  38.31 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 445 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  34.02 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  33.75 
 
 		 448 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.38 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.21 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  29.27 
 
 		 449 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.67 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  33.82 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  31.34 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.3 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.03 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.3 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.31 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  46.27 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  45 
 
 		 177 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.95 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.1 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.35 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  38.24 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.52 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.66 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  41.43 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.44 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  41.43 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  41.43 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  40.3 
 
 		 118 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  34.69 
 
 		 186 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  27.18 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  37.31 
 
 		 158 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.36 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  33.03 
 
 		 158 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.47 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.32 
 
 		 184 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.82 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  28.75 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  25.29 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.23 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.75 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  22.29 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.85 
 
 		 182 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.47 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  45 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.25 
 
 		 177 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.38 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  35 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  35.53 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.53 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.83 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  37.35 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.94 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  38.1 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.94 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.94 
 
 		 176 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  30.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 182 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>