132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 268 aa  560  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  64.18 
 
 		 264 aa  361  6e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.92 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  36.47 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  34.03 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  33.72 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  34.41 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  31.42 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  32.95 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  31.42 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  27.61 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.8 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.86 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  23.13 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.37 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.18 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.91 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  27.01 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.92 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.92 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  24.02 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  27.73 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  26.74 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  29.11 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  26.12 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  26.14 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.81 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2775  hypothetical protein  26.97 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.03615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.46 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.81 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.13 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  23.47 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0865  amidohydrolase 2  23.51 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2828  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  24.36 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  22.56 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2575  amidohydrolase  27.94 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  31.07 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  25.97 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1101  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.43 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2903  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  26.34 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.02 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.6 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.9 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  22.7 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3364  amidohydrolase 2  26.2 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.34 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  24.05 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0780  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  22.89 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  22.04 
 
 		 387 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  28.9 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  29.48 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  25 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  25.1 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  25 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>