122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2680 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2680  signal-transduction protein  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0686487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  42.28 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  38.2 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.35 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  30 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  28.15 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  28.21 
 
 		 513 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 431 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  29.92 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  26.23 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  28.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  28.93 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  29.09 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  31.73 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  29.84 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  28.32 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.16 
 
 		 837 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.09 
 
 		 845 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  28.04 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  26.61 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  24.16 
 
 		 241 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  26.61 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  27.12 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2758  signal-transduction protein  28.85 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124803 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  25.62 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  23.93 
 
 		 502 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.93 
 
 		 644 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25 
 
 		 650 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  27.35 
 
 		 503 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  28.23 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  31.73 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  26.5 
 
 		 513 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  27.52 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  30.39 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  28.23 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.65 
 
 		 495 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  25.22 
 
 		 490 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  28.91 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  31.5 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  33.6 
 
 		 353 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.19 
 
 		 600 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  35.09 
 
 		 660 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  28 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.66 
 
 		 688 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 609 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  29.85 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 624 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  27.35 
 
 		 487 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  25.17 
 
 		 249 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  29.06 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1884  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  29.36 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  24.8 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  25.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  26.92 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3005  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  23.36 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.75 
 
 		 494 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 		 625 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  25.76 
 
 		 615 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.62 
 
 		 618 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.63 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.36 
 
 		 483 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  27.88 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 688 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.23 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.04 
 
 		 675 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.83 
 
 		 488 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  24.8 
 
 		 459 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.21 
 
 		 660 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  25.32 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  22.97 
 
 		 229 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  26.03 
 
 		 218 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6392  putative signal transduction protein with CBS domains  32.53 
 
 		 133 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  25.55 
 
 		 141 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  27.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  25 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>