209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0811 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  100 
 
 		 332 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  34 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  37.28 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  36.52 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  36.2 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  36.2 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  38.43 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  33.77 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  36.9 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  35.48 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  35.13 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  36.13 
 
 		 271 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  31.31 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  30.82 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 		 286 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  35.21 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  33.21 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  35.14 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.58 
 
 		 268 aa  133  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.15 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.99 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.23 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.13 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.02 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  34.3 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  32.77 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32.3 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.2 
 
 		 599 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.92 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  32.11 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  30.18 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  33.06 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  30.86 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  30.36 
 
 		 276 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.63 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  31.23 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  31.44 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  28.96 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.43 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  29.49 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  30.23 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.8 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  26.97 
 
 		 294 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  26.26 
 
 		 280 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 268 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  28.21 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  29.2 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  27.09 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.69 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  26.91 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  26.52 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  26.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  25.91 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  26.67 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.26 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  24.66 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  24.66 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  24.32 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  27.5 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  27.41 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  25.38 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  25.57 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2969  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.28 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.534819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.6 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  23.41 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.09 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  31.28 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.07 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.46 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.56 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.56 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  29.82 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  29.95 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  31.36 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.91 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.77 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.36 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  30.29 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.63 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.11 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12526  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase alpha subunit scoA  25.21 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399784  normal  0.0529319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0517  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  30.99 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  30.05 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.03 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.7 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4635  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.63 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.853485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6963  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.48 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.550727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.11 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.68 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.44 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.52 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.52 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  30.52 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>