More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0386 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
327 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  49.23 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  48.77 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  45.28 
 
 
328 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  47.99 
 
 
327 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  47.99 
 
 
327 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  43.94 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  45.9 
 
 
328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  48.49 
 
 
325 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  44.51 
 
 
328 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  44.24 
 
 
329 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  44.04 
 
 
328 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  43.94 
 
 
329 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  44 
 
 
332 aa  279  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  45.12 
 
 
321 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  41.28 
 
 
328 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  42.02 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  42.9 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  41.77 
 
 
326 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  41.41 
 
 
336 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  42.51 
 
 
335 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  44.48 
 
 
336 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  41.1 
 
 
336 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  40.49 
 
 
336 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  39.09 
 
 
336 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  34.15 
 
 
333 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  37.83 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  34.05 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  32.06 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  32.32 
 
 
335 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  30.25 
 
 
338 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.61 
 
 
348 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.62 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  33.74 
 
 
366 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  33.95 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.3 
 
 
391 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  32.01 
 
 
323 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33.49 
 
 
369 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  32.01 
 
 
323 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.35 
 
 
360 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  29.32 
 
 
322 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  34.96 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  34.96 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  36.84 
 
 
387 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  35.98 
 
 
405 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.37 
 
 
363 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  35.4 
 
 
320 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  32.51 
 
 
369 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  36.54 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  33.01 
 
 
325 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 
388 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  31.33 
 
 
390 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  31.34 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  31.49 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  37.65 
 
 
370 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  37.17 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  28.43 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 
239 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  28.42 
 
 
401 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  36.27 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  34.09 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  35.78 
 
 
407 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.08 
 
 
451 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  35.78 
 
 
407 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  31.87 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.82 
 
 
425 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.59 
 
 
428 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  27.89 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  35.35 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  34.24 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  29.34 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  36.02 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  28.4 
 
 
419 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  30.08 
 
 
427 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  33.66 
 
 
429 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.02 
 
 
739 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  34.52 
 
 
408 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  28.27 
 
 
477 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  32.42 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  28.32 
 
 
804 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  32.71 
 
 
410 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  32.04 
 
 
389 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  30.77 
 
 
599 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.98 
 
 
732 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  27.78 
 
 
426 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  30.36 
 
 
407 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  37.33 
 
 
393 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  31.34 
 
 
810 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.24 
 
 
639 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  31.53 
 
 
412 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  30.2 
 
 
425 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  33.18 
 
 
394 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.19 
 
 
666 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.33 
 
 
757 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  33.49 
 
 
371 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  28.51 
 
 
631 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  33.8 
 
 
426 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.84 
 
 
781 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>