More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1825 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  56.16 
 
 
203 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 
203 aa  254  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  55.17 
 
 
203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  57.14 
 
 
203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  53.47 
 
 
202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  51.96 
 
 
204 aa  239  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  52.76 
 
 
204 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 
201 aa  228  7e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 
207 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 
213 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
221 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.18 
 
 
200 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 
219 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
220 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 
217 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 
215 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 
216 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.69 
 
 
206 aa  139  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 
223 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 
214 aa  138  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 
196 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
209 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  37.37 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.37 
 
 
217 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 
220 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
218 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  38.31 
 
 
220 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 
208 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
221 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 
219 aa  134  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 
221 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 
220 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.95 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.8 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  33.83 
 
 
217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38 
 
 
218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.95 
 
 
220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.95 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.61 
 
 
217 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 
217 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
218 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
218 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 
220 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 
207 aa  130  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
218 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
218 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  35.07 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  40.88 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  40.72 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  38.81 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  36.18 
 
 
207 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  40.49 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  35.89 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 
222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.31 
 
 
221 aa  127  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 
215 aa  127  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 
230 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  34.95 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  37.14 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  42.04 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
223 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 
214 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  44.65 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
220 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>