More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0510 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  100 
 
 		 680 aa  1391    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.24 
 
 		 686 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 705 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 710 aa  124  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.17 
 
 		 641 aa  97.8  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 649 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  31.84 
 
 		 615 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.43 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  22.61 
 
 		 704 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 799 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 697 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.82 
 
 		 732 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.7 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.79 
 
 		 721 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  36.49 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.79 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  35.26 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.7 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.7 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  33.53 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  33.76 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 665 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  36.03 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 799 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36.03 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36.03 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.03 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.03 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 737 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  21.81 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.03 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.03 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  36.03 
 
 		 659 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.03 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.03 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.03 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.03 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  22.56 
 
 		 704 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.41 
 
 		 685 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  34.39 
 
 		 642 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  45.98 
 
 		 673 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1596  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.25 
 
 		 685 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.25 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.41 
 
 		 821 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 612 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.25 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.25 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.25 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.68 
 
 		 655 aa  71.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  31.55 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  30.56 
 
 		 652 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0795  thiamine monophosphate synthase  34.33 
 
 		 793 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.33 
 
 		 716 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  32.28 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 699 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  27.65 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 643 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.27 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 		 698 aa  67.4  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 670 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 742 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.09 
 
 		 639 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 635 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 613 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  33.09 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  37.14 
 
 		 687 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 762 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  30.15 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2640  4Fe-4S cluster binding  31.97 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.956592  normal  0.352688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>