More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0993 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  64.51 
 
 		 523 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  95.25 
 
 		 547 aa  999    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  100 
 
 		 541 aa  1097    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  96.3 
 
 		 541 aa  1006    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  56.48 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  56.28 
 
 		 525 aa  542  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  56.07 
 
 		 520 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  57.29 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  39.34 
 
 		 235 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  39.34 
 
 		 235 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  36.22 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  37.04 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  37.57 
 
 		 371 aa  118  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  36.84 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  37.33 
 
 		 223 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  35.16 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  35.98 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  32.23 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.99 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  35.43 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  38.17 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.41 
 
 		 226 aa  104  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 519 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  33.7 
 
 		 386 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  37.43 
 
 		 489 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  35.26 
 
 		 511 aa  96.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  35.35 
 
 		 286 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  32.6 
 
 		 219 aa  93.6  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  36.45 
 
 		 639 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  33.33 
 
 		 625 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  31.73 
 
 		 348 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 332 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 625 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 625 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 376 aa  90.5  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  34.8 
 
 		 396 aa  90.5  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 625 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  32.18 
 
 		 625 aa  90.1  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  32.32 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  35.19 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35.68 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  36.13 
 
 		 228 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.63 
 
 		 267 aa  82.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  32.57 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.39 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  35.14 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  46.67 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.15 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.03 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  34.34 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  38.46 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  31.61 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  33.01 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  33.01 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  30.92 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  32.39 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.51 
 
 		 289 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  44.33 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  34.16 
 
 		 229 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 289 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  35 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.09 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  34.34 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  31.98 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.73 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.82 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  46.59 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  32 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  36.23 
 
 		 291 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  34.01 
 
 		 669 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2679  Rhomboid family protein  40.2 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  33.78 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  28.96 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  32.74 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  37.86 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  35.46 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  31.15 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  30.34 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  32.26 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  36.97 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  29.67 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  38.1 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  31.51 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  31.18 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  32.92 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  35.34 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.3 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.53 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.3 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  36.96 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  30.41 
 
 		 556 aa  67  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.59 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>