More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3587 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3587  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 315 aa  607  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2856  cation diffusion facilitator family transporter  68.04 
 
 		 308 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1506  cation efflux protein  66.88 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3473  cation efflux protein  63.67 
 
 		 315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5161  cation diffusion facilitator family transporter  66.56 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1714  cation diffusion facilitator family transporter  63.28 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0977  cation diffusion facilitator family transporter  54.23 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2351  cation diffusion facilitator family transporter  57 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.062875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2032  cation diffusion facilitator family transporter  55.21 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0143308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2862  cation diffusion facilitator family transporter  57.88 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0295  cation diffusion facilitator family transporter  60.93 
 
 		 299 aa  279  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3353  cation diffusion facilitator family transporter  54.55 
 
 		 318 aa  278  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0755  cation diffusion facilitator family transporter  54.09 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.730311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0967  cation efflux system protein  56.13 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0464  cation diffusion facilitator family transporter  54.07 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3835  cation diffusion facilitator family transporter  55.84 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1792  cation diffusion facilitator family transporter  55.37 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  hitchhiker  0.007542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0854  cation diffusion facilitator family transporter  55.06 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.699634  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3941  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1698  cation efflux protein  52.23 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0335559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2328  cation diffusion facilitator family transporter  46.23 
 
 		 325 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3193  cation diffusion facilitator family transporter  47.76 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4663  putative cation efflux system protein  53.65 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4110  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4761  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0624226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3406  cation diffusion facilitator family transporter  50.31 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0492  cation efflux system protein  46.18 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.138389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2088  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 425 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000160471  normal  0.0633759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2257  cation diffusion facilitator family transporter  39.95 
 
 		 421 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2075  cation diffusion facilitator family transporter  44.17 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.055062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0891  putative cation transporter  47.6 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000116016  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3106  cation efflux transporter  59.43 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2045  cation efflux family protein  40.82 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2534  cation diffusion facilitator family transporter  48.45 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.730315  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06410  hypothetical protein  47.39 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1179  cation diffusion facilitator family transporter  46.47 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2100  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.44184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3333  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.807298  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2726  cation diffusion facilitator family transporter  49.85 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0444  cation diffusion facilitator family transporter  50.74 
 
 		 368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3400  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0633107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4322  putative zinc transporter ZitB  42.77 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2648  cation diffusion facilitator family transporter  43.63 
 
 		 312 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0477  cation diffusion facilitator family transporter  48.27 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0396  cation diffusion facilitator family transporter  49.24 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2517  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02793  heavy metal transporter  46.11 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0246  cation efflux protein  50 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3337  cation efflux protein  41.82 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47430  putative metal transporter  47.6 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4094  putative metal transporter  47.45 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4656  cation diffusion facilitator family transporter  48.1 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1450  cation diffusion facilitator family transporter  68.67 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4528  cation diffusion facilitator family transporter  52.05 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298774  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1755  cation efflux family protein  42.73 
 
 		 365 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.763492  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5279  cation diffusion facilitator family transporter  61.87 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2847  Co/Zn/Cd efflux system component  61.7 
 
 		 422 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0570  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.924054  normal  0.449754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1090  putative cation efflux related membrane protein  60.99 
 
 		 422 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2694  cation diffusion facilitator family transporter  60.99 
 
 		 422 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1585  cation diffusion facilitator family transporter  59.29 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3201  cation diffusion facilitator family transporter  60.43 
 
 		 430 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5150  cation diffusion facilitator family transporter  60.43 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.634213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0390  cation efflux system protein  56.67 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5056  cation diffusion facilitator family transporter  58.99 
 
 		 426 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1677  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 		 434 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.829467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2939  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 		 434 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2539  cation diffusion facilitator family transporter  58.27 
 
 		 434 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212493  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0050  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  57.55 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2374  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00210779  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1128  cation diffusion facilitator family transporter  57.55 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0198  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2043  cation diffusion facilitator family transporter  52.42 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2106  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 404 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1868  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0527633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2231  cation diffusion facilitator family transporter  47.89 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.011038  normal  0.481108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2100  cation diffusion facilitator family transporter  47.26 
 
 		 387 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0353421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11230  cation transporter  54.62 
 
 		 354 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.482612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2230  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.968975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4425  cation diffusion facilitator family transporter  51.08 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497807  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  28.52 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  31.33 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  28.52 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  31.35 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2772  putative metal transport transmembrane protein  47.48 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.799335  normal  0.345605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  31.35 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  31.35 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  31.35 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  31.35 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.27 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.4 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  28.15 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>