91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3372 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  76.65 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  76.14 
 
 		 192 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  75.13 
 
 		 193 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  76.14 
 
 		 194 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  74.62 
 
 		 194 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  74.62 
 
 		 194 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  75.13 
 
 		 194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  75.13 
 
 		 194 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  74.62 
 
 		 194 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  74.62 
 
 		 194 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  74.11 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  75.13 
 
 		 194 aa  299  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  70.05 
 
 		 197 aa  298  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  73.1 
 
 		 194 aa  297  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  74.03 
 
 		 194 aa  289  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  37.85 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  38.19 
 
 		 198 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  37.06 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  37.69 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  35.23 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  38.61 
 
 		 208 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  39.87 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  37.08 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  33.33 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  38.61 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  34.81 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  37.25 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  34.81 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  37.97 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  33.53 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  31.5 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  31.43 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  32.91 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  36.71 
 
 		 167 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  32.93 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  33.7 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  32.99 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  32.28 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  35.9 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  30.85 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  35.9 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  31.65 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  38.56 
 
 		 252 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  34.78 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  31.28 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  31.28 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  35.83 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  36.36 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  33.52 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  34.39 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  33.75 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  33.54 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.28 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  37.09 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  25.26 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  31.15 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.26 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  34.02 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  34.29 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  33.85 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  29.52 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  31.31 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  32.96 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  31.79 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  31.13 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  31.69 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  28.57 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  26.16 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  26.09 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  24.62 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  28.89 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  22.6 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  25.57 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  24.19 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  27.81 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  22.53 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  23.08 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  23.85 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  24.48 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0397  fimbrial assembly family protein  26.04 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  22.16 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  29.82 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4065  Fimbrial assembly family protein  26.32 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  22.16 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0334  Fimbrial assembly family protein  24.52 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  26.89 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  25.84 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  18.87 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>