96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2690 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  46.11 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  44.15 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  43.32 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  43.62 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  45.62 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  43.09 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  43.78 
 
 		 219 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  41.57 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  43.21 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  43.21 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  37.08 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  43.65 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  37.29 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  42 
 
 		 221 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  37.42 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  40.12 
 
 		 290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  32.09 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.09 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  34.39 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  35.03 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  41.77 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  33.33 
 
 		 194 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  33.33 
 
 		 194 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  41.77 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  42 
 
 		 221 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  33.33 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  33.9 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  33.7 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  35.03 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  33.9 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  37.5 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  33.9 
 
 		 194 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  34.46 
 
 		 193 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  33.9 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  40.13 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.02 
 
 		 197 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  32.77 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  36.84 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  38.5 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  35.11 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  32.61 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  31.58 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  37.71 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  37.13 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  31.94 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  29.89 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  33.86 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  34.36 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  32.82 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  34.21 
 
 		 211 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  30.85 
 
 		 189 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  33.85 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  34.03 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  30.48 
 
 		 214 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  33.52 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  31.61 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  37.95 
 
 		 227 aa  94.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  33.68 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  38.51 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  29.53 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  33.55 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  31.11 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  33.55 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  29.12 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  29.73 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  30 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  24.16 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  36 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  23.94 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  29.17 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  27.38 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  28.95 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  29.89 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  26.51 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  28.65 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.24 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  26.23 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  25.75 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  26.62 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  28.48 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  23.03 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  24.71 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0397  fimbrial assembly family protein  26.71 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  25.41 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  23.56 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.46 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  27.11 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  23.76 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  25.95 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  22.42 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  23.26 
 
 		 373 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0733  Fimbrial assembly family protein  24.16 
 
 		 571 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0776  fimbrial assembly family protein  23.81 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0863  general secretory pathway protein L  23.81 
 
 		 378 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00948557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06060  Tfp pilus assembly protein PilN  27.53 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>