30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1470 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  31.94 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  31.19 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  31.25 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  30.21 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  33.56 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  29.52 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  38.64 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  27 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  37.5 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  33.98 
 
 
166 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  32.33 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  23.42 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  28.68 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  25 
 
 
194 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.54 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  24.39 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  23.46 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  30.21 
 
 
189 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.08 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  24.39 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  26.67 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  23.93 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  26.89 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  22.16 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  21.66 
 
 
194 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  25.71 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  25.71 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  25.71 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  24.37 
 
 
193 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>