72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1811 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 191 aa  373  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  62.23 
 
 		 190 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  62.37 
 
 		 191 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  66.47 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  67.05 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  49.73 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  53.72 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  36.57 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  38.15 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  37.58 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  36.94 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  39.43 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  30.77 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  32.05 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  24.29 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.29 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  30.11 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  31.19 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.77 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  25.4 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  25.4 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  26.92 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  26.99 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  24.29 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  26.38 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  26.38 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  25.16 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  24.34 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  23.81 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.16 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  23.81 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  25.77 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  21.09 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  22.96 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  23.28 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  23.28 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.52 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  28.97 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  25.52 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  21.05 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  20.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  23.18 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  29.05 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  24.83 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  21.29 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  21.91 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  22.39 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  25.17 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  28.97 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  18.39 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.48 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  28.86 
 
 		 177 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  23.46 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1544  fimbrial assembly  25.64 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.103111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  18.42 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  25.69 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  25.13 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  18.99 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2407  Fimbrial assembly family protein  24.62 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  23.46 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  21.74 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  24.31 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  23.78 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  21.48 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  24.52 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  23.88 
 
 		 188 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  27.59 
 
 		 213 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  23.03 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  21.03 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  20.53 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>