56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0993 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  54.74 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  55.03 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  62.9 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  49.73 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  48.44 
 
 		 202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  48.91 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  36.76 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  31.25 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  31.49 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  29.17 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  28.12 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.32 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  27.32 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  31.15 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  33.11 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  27.32 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  29.52 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  25.41 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  23.76 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  29.44 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.15 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  26.9 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  22.56 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  25.13 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  27.1 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  23.04 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.33 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  22.49 
 
 		 290 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.13 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1678  Fimbrial assembly family protein  24.26 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  28.29 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  22.37 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  27.52 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  23.53 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  21.71 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  22.51 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  24.86 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  25.49 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2407  Fimbrial assembly family protein  24.18 
 
 		 332 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  23.08 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  23.32 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  23.42 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  26.14 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  21.66 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  23.28 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  24.39 
 
 		 252 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  26.11 
 
 		 191 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  23.7 
 
 		 189 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  25 
 
 		 214 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  26.71 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>