87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0209 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  82.47 
 
 		 194 aa  327  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  82.47 
 
 		 194 aa  325  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  81.96 
 
 		 194 aa  324  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  81.96 
 
 		 194 aa  323  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  80.41 
 
 		 192 aa  322  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  77.84 
 
 		 194 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  79.9 
 
 		 194 aa  316  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  76.68 
 
 		 193 aa  315  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  77.84 
 
 		 194 aa  314  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  77.84 
 
 		 194 aa  314  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  77.72 
 
 		 193 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  76.8 
 
 		 194 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  75.13 
 
 		 197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  73.71 
 
 		 194 aa  293  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  71.57 
 
 		 197 aa  288  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  36.27 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  37.95 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  38.25 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  37.44 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  37.29 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  36.84 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  38.61 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  37.5 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  37.37 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  36.53 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  35.29 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  36.53 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  38.42 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  38.61 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  37.34 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  34.15 
 
 		 290 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  39.24 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  36.71 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  34.84 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  33.17 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  36.08 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  36.08 
 
 		 221 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  32.78 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  32.83 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  30.38 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  30.38 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  31.98 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  34.38 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  36.02 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  33.69 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  33.15 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  36.71 
 
 		 252 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  34.18 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  29.83 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.83 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  34.81 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  34.25 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  32.46 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  33.15 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  31.67 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  31.67 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  33.87 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  32.09 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  32.69 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  32.61 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  32.89 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  32.79 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  28.49 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  35.29 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  32.07 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  31.85 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  27.93 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  28.49 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.87 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  28.96 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  22.6 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  24.72 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  23.73 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0397  fimbrial assembly family protein  30.21 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  26.19 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  23.63 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  26.19 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  23.3 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  21.93 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  30.07 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  26.06 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4065  Fimbrial assembly family protein  31.51 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  26.22 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  31.68 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  24.37 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>