73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5082 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 178 aa  342  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  94.38 
 
 		 178 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  88.2 
 
 		 178 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  56.18 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.38 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  28.25 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  27.44 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  28.75 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  32 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.88 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  30.06 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  29.41 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.88 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  28.21 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.16 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  25.15 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  26.55 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  28.48 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  24.05 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  32.22 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  29.68 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  28.4 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  25.33 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  28.41 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.55 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  27.68 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  29.55 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  26.11 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  26.11 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  28 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  22.92 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  25.93 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  27.59 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  25.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  29.88 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  25.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  26.79 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  26.19 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  24.39 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  24.07 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  27.38 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  22.84 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  23.46 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  25.93 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  26.79 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  24.4 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  26.14 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  29.27 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  28.93 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  28.12 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  30.25 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  29.67 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  27.21 
 
 		 210 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  23.42 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  25.61 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  25.69 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.16 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  23.46 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  23.21 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.7 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  27.71 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  26.85 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  24.28 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0397  fimbrial assembly family protein  26.12 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1544  fimbrial assembly  30.86 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.103111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  25.49 
 
 		 203 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1102  fimbrial assembly protein  21.62 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  26.14 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  27.61 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  28.38 
 
 		 214 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>