56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02683 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 373 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0776  fimbrial assembly family protein  59.41 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0863  general secretory pathway protein L  59.14 
 
 		 378 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00948557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0553  Fimbrial assembly family protein  56.67 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2176  fimbrial assembly family protein  33.1 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  31.71 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3310  general secretion pathway protein L, putative  30.08 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1121  general secretion pathway protein l, putative  27.61 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3144  fimbrial assembly  29.75 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1521  Fimbrial assembly family protein  28.41 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0573904  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1285  putative general secretion pathway protein L, GspL  27.84 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  28.02 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1590  fimbrial assembly family protein  25.19 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493789  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0734  fimbrial assembly  26.16 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0675563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  25.79 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  31.51 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  25.65 
 
 		 220 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0917  Fimbrial assembly family protein  33.33 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  25.65 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  28.21 
 
 		 219 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2619  putative general secretion pathway protein L  24.91 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  28.75 
 
 		 221 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2095  fimbrial assembly family protein  24.91 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0807472  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.88 
 
 		 208 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  25.14 
 
 		 198 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  26.63 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1306  fimbrial assembly family protein  23.77 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  decreased coverage  0.00904381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  27.27 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3002  fimbrial assembly  26.25 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  27.32 
 
 		 187 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  30.91 
 
 		 188 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 		 187 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  26.55 
 
 		 187 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  31.11 
 
 		 191 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  29.03 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2114  fimbrial assembly family protein  32.1 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  25.86 
 
 		 194 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4153  fimbrial assembly family protein  27.69 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0256547  hitchhiker  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  26.2 
 
 		 194 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  26.11 
 
 		 203 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  24.47 
 
 		 192 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  25.41 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  25.73 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  22.28 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  25.41 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  24.34 
 
 		 193 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  27.96 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  23.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  24.08 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  29.27 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  25.13 
 
 		 194 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  23.56 
 
 		 194 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  23.56 
 
 		 194 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.12 
 
 		 193 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  32.22 
 
 		 167 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2027  fimbrial assembly family protein  27.46 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>