35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0758 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 373 aa  749    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1121  general secretion pathway protein l, putative  34.37 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0553  Fimbrial assembly family protein  34.39 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2176  fimbrial assembly family protein  32.96 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3144  fimbrial assembly  31.03 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3310  general secretion pathway protein L, putative  30.42 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0776  fimbrial assembly family protein  31.44 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0863  general secretory pathway protein L  32.86 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00948557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  30.81 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1521  Fimbrial assembly family protein  26.88 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0573904  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1285  putative general secretion pathway protein L, GspL  30 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3002  fimbrial assembly  28.04 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2619  putative general secretion pathway protein L  27.85 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0734  fimbrial assembly  26.14 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0675563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1590  fimbrial assembly family protein  26.67 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493789  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1788  Fimbrial assembly family protein  27.4 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0126663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4153  fimbrial assembly family protein  27.11 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0256547  hitchhiker  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1306  fimbrial assembly family protein  25.09 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  decreased coverage  0.00904381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0888  fimbrial assembly family protein  30.6 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000454237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0917  Fimbrial assembly family protein  24 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  31.33 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2114  fimbrial assembly family protein  34.44 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3660  fimbrial assembly family protein  34.02 
 
 		 509 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2095  fimbrial assembly family protein  44.19 
 
 		 345 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0807472  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1037  fimbrial assembly family protein  23.65 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.13729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  24.63 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  29.07 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.92 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2027  fimbrial assembly family protein  31.46 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  24.24 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.88 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  26.77 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  25.93 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>