25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0776 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0776  fimbrial assembly family protein  100 
 
 
378 aa  751    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0393461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0863  general secretory pathway protein L  99.21 
 
 
378 aa  746    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00948557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02683  general secretion pathway protein L  59.41 
 
 
373 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0553  Fimbrial assembly family protein  50.42 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0642076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  32 
 
 
373 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2176  fimbrial assembly family protein  29.73 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1121  general secretion pathway protein l, putative  26.74 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3310  general secretion pathway protein L, putative  27.49 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3144  fimbrial assembly  26.35 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366648  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1285  putative general secretion pathway protein L, GspL  27.01 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442557  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2619  putative general secretion pathway protein L  24.53 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1306  fimbrial assembly family protein  24.03 
 
 
351 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  decreased coverage  0.00904381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0734  fimbrial assembly  24.07 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0675563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2114  fimbrial assembly family protein  29.06 
 
 
359 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463917  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0917  Fimbrial assembly family protein  38.6 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3002  fimbrial assembly  26.15 
 
 
356 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1590  fimbrial assembly family protein  21.79 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493789  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1521  Fimbrial assembly family protein  37.88 
 
 
332 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0573904  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2095  fimbrial assembly family protein  23.81 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0807472  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  29.17 
 
 
221 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  29.17 
 
 
221 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.27 
 
 
208 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4153  fimbrial assembly family protein  25.29 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0256547  hitchhiker  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  29.47 
 
 
191 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  24.7 
 
 
219 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>