78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2717 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  44.09 
 
 
191 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  47.8 
 
 
196 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  44.63 
 
 
191 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  32.22 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  33.12 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.25 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  34.39 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  30.56 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  28.73 
 
 
193 aa  87.8  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  30.41 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  30.41 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  30.41 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  30.99 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  29.86 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  32.48 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  30.57 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  30.41 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  31.85 
 
 
194 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.03 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  29.17 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  31.21 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  31.21 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  32.48 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  28.93 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  32.48 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.85 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  28.39 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  28.39 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  28.97 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  31.85 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  28.19 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  26.58 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  31.25 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  27.22 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  21.67 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  29.68 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  26.67 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  29.55 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  31.06 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.6 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  23.6 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  28.57 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  32.26 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  27.66 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  28.11 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  28.75 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  29.12 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  27.78 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  29.93 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  27.62 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  27.07 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  31.69 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  28.09 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  27.47 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  22.84 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  24.31 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  28.75 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  20.97 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  28.26 
 
 
213 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  30 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  22.11 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  27.21 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  32.32 
 
 
214 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  29.93 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  25 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  24.11 
 
 
210 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  23.81 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  24.11 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  26.11 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  24.83 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  23.4 
 
 
210 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  22.07 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  24.73 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  24.86 
 
 
193 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  24.04 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  23.78 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>