95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2210 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  60.11 
 
 		 191 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  59.89 
 
 		 191 aa  214  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  47.8 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  31.94 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  34.1 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  33.15 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  32.79 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  30.9 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  30.9 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  32.02 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.42 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  30.9 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  30.34 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.28 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  31.05 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  31.22 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.15 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  31.46 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  31.46 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  32.3 
 
 		 184 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  30.9 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  31.06 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  30.89 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  33.15 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  31.22 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.97 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  28.89 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  29.1 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  29.67 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28.02 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28.87 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  30.17 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  25.27 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  29.03 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  25.32 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  26.06 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  26.06 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  27.85 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28.76 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  30.86 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  30.86 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  26.52 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  31.68 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  31.03 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  31.54 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  25.97 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  34.62 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  25.17 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  30.1 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  32.72 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  28.1 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  27.07 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  26.32 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  24.32 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  29.57 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  28.48 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  29.81 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  28.98 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  30.65 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  29.45 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  28.8 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  28.74 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  25.91 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  24.46 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  24.46 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  29.75 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  28.87 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  30.06 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  30.6 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  30.77 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  29.78 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  24.06 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  27.04 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  18.39 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  20.88 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  24.1 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  20.81 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  23.68 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  21.35 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  20.9 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  26.8 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06060  Tfp pilus assembly protein PilN  23.42 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0334  Fimbrial assembly family protein  24.55 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  22.04 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4065  Fimbrial assembly family protein  24.48 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0397  fimbrial assembly family protein  22.22 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  21.47 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  20.73 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  19.69 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3002  Fimbrial assembly family protein  21.39 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000637967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  21.78 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  23.42 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0256  Fimbrial assembly family protein  21.47 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>