78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0332 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  36.57 
 
 		 191 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  34.66 
 
 		 202 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  35.43 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  32.77 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  31.25 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  30.73 
 
 		 191 aa  98.6  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  29.94 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  29.44 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  29.38 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  32.02 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  31.28 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.28 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  30.17 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  29.89 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  27.68 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  22.03 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  24.16 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  24.16 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  24.16 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.31 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  23.6 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  23.73 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  24.16 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  30.63 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  22.6 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  30.63 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  26.01 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  28.33 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  23.6 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  23.6 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  23.6 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  27.78 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  25.54 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  21.47 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  27 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  21.47 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  20.34 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  28.05 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  29.03 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.6 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  28.89 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  31.47 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  21.79 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  28.17 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  25.44 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  20.99 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  30.06 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  25.68 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  25.61 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  25.9 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  23.89 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  27.44 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  25.34 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  25.34 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  27.44 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  24.85 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  25.97 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  23.31 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  25.61 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  24.68 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  21.02 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  23.38 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  20.69 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06060  Tfp pilus assembly protein PilN  26.45 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  25.48 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  26.49 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  24.68 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  22.65 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  23.2 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.09 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  16.67 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  23.08 
 
 		 191 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  25.34 
 
 		 210 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  24.24 
 
 		 198 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>