78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0673 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 163 aa  330  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  80.27 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  67.79 
 
 		 206 aa  223  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  63.35 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  58.02 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  61.33 
 
 		 203 aa  197  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  60.67 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  55.97 
 
 		 203 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  57.23 
 
 		 214 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  52.23 
 
 		 207 aa  168  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  56.43 
 
 		 212 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  52.52 
 
 		 213 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  45.91 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  43.21 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  48.91 
 
 		 210 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  48.18 
 
 		 210 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  44.74 
 
 		 210 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  41.5 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  36.88 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  40.14 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  38.71 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  39.13 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  39.44 
 
 		 191 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  38.85 
 
 		 219 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  37.74 
 
 		 198 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  37.32 
 
 		 196 aa  94.4  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  39.84 
 
 		 290 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  38.69 
 
 		 188 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  35.06 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  34.42 
 
 		 194 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  37.3 
 
 		 187 aa  91.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  34.42 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  40.17 
 
 		 187 aa  90.9  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  42.73 
 
 		 167 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  42.15 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.67 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  41.32 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  38.21 
 
 		 220 aa  87.8  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  38.21 
 
 		 221 aa  87.4  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  32.65 
 
 		 194 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  35 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  35 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  32.89 
 
 		 252 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  32.89 
 
 		 193 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  34.29 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  32.47 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  34.29 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  34.62 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  32.86 
 
 		 197 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  29.11 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.13 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  32.85 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  31.62 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.22 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  27.22 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  34.04 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  35.46 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  32.74 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  31.58 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  32.14 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  31.86 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  32.31 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  28.87 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  28.66 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  29.93 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.32 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  23.81 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  29.73 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  28.26 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  27.27 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  31.48 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  30.25 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  25.53 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  25.27 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  24.49 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  23.21 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  30.7 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>