85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0384 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 178 aa  347  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5132  fimbrial assembly family protein  59.55 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4955  fimbrial assembly family protein  55.62 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5082  fimbrial assembly family protein  56.18 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  27.85 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  33.33 
 
 		 290 aa  74.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  27.59 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  29.09 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  27.01 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  26.22 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  28.41 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  28.41 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  29.76 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  27.33 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  25.17 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  30.82 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.38 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  26.11 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  29.82 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  29.94 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0276  Fimbrial assembly family protein  31.93 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.357338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2920  fimbrial assembly  30.38 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  27.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  29.01 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  28.66 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  28.65 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  28.65 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  28.65 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  29.8 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  28.65 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  26.57 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  26.88 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  27.04 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.78 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  28.4 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.71 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  27.53 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  31.71 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  27.78 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  27.53 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  24.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  28.92 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.81 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  30.56 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  29.38 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  31.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  26.38 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  29.28 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00032  fimbrial assembly protein PilN  23.08 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0406  fimbrial assembly  31.98 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108906  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  26.62 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  26.45 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  30 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  26.49 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  24.52 
 
 		 191 aa  50.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  32.39 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  27.39 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  25.29 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  28.14 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.87 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  26.11 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0673  fimbrial assembly family protein  25.53 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  27.63 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1102  fimbrial assembly protein  24.7 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  26.76 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  29.56 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  23.23 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0159  fimbrial assembly family protein  25.15 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.519903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  27.1 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  27.43 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  26.25 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0397  fimbrial assembly family protein  24.22 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  28.48 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  26.11 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  27.1 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  20.42 
 
 		 212 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  23.13 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  23.13 
 
 		 203 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3970  fimbrial assembly protein PilN  25.28 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3731  hypothetical protein  25.28 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0221  fimbrial assembly family protein  25.28 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.632717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.52 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>