30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3887 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4065  Fimbrial assembly family protein  72.49 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0256  Fimbrial assembly family protein  32.98 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  32.87 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0334  Fimbrial assembly family protein  30.16 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  29.37 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  29.37 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  29.37 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  29.37 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  30.07 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  30.82 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  29.05 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  29.86 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  27.81 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  30.07 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  29.86 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  29.86 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0209  fimbrial assembly family protein  30.07 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0930863  hitchhiker  0.00864112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0468  type IV pilus biogenesis protein PilN  28.57 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  27.97 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  27.89 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  27.94 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  27.94 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  22.28 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  24.86 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  21.48 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  26.42 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  25.44 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  23.7 
 
 		 193 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4609  fimbrial assembly family protein  33.77 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00150076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>