37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0334 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0334  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0256  Fimbrial assembly family protein  41.15 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0342405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  29.69 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4065  Fimbrial assembly family protein  27.89 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.52 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2905  Fimbrial assembly family protein  27.81 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0485843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  27.81 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  23.73 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  24.55 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  27.18 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.56 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4609  fimbrial assembly family protein  31.69 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00150076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  23.32 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0371  fimbrial assembly family protein  23.12 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.366153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0282  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.28 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  21.65 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3898  fimbrial assembly family protein  23.28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0126413  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3710  fimbrial assembly family protein  22.75 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0590924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.67 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3702  fimbrial assembly family protein  22.75 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  27.88 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0243  fimbrial assembly family protein  23.28 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  25.64 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.64 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  21.97 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  22.94 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  22.94 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1590  fimbrial assembly family protein  30 
 
 		 355 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493789  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  24.59 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  26.75 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  23.96 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0257  fimbrial assembly  22.58 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0336  fimbrial assembly family protein  21.29 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4269  fimbrial assembly family protein  21.29 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.434726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>