47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2668 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  94.44 
 
 		 202 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  66.47 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  61.85 
 
 		 190 aa  214  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  59.54 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  48.91 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  53.85 
 
 		 189 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  36.67 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  40.34 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  37.82 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  35.9 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  36.87 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  31.55 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  34.84 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.1 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  22.1 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  31.11 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  29.11 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  23.6 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  23.27 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  29.02 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  20.88 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  23.31 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  23.31 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  22.28 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  23.76 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  25.27 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.91 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  27.07 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0609  fimbrial assembly  23.3 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.157737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  25.77 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.22 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  20.9 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2407  Fimbrial assembly family protein  21.31 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  26.6 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  25.54 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.03 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.69 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  23.64 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  24.83 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  23.53 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  27.1 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.68 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  20.32 
 
 		 196 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0248  Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  21.14 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2099  Fimbrial assembly family protein  23.4 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>