23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1983 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  40.33 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  26.92 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  25.54 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  26.88 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  23.76 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  24.53 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  23.08 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  27.74 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  28.48 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  26.35 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  21.91 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  26.49 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  26.99 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3372  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.82 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0746534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  21.74 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0234  fimbrial assembly family protein  28.77 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  20.1 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  22.98 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  24.85 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  26.36 
 
 		 203 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  22.5 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>