63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2031 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2031  type IV pilus biogenesis protein PilN  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  77.49 
 
 		 190 aa  294  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1811  fimbrial assembly family protein  62.37 
 
 		 191 aa  247  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  55.03 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2668  Fimbrial assembly family protein  58.76 
 
 		 182 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000386348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1547  Fimbrial assembly family protein  59.32 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1641  Fimbrial assembly family protein  54.14 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  36 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  31.28 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0687  fimbrial assembly family protein  39.06 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  37.04 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  35.8 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  32.07 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0738  type IV pilus biogenesis protein PilN  25.26 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0218602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0886  Fimbrial assembly family protein  25.26 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  34.19 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1470  fimbrial assembly protein  32.29 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227533  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  29.75 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  28.8 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  27.75 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1859  fimbrial assembly membrane protein  23.47 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0439918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1788  fimbrial assembly family protein  23.47 
 
 		 220 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1882  type IV pilus biogenesis fimbrial assembly  22.45 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  22.46 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2172  fimbrial assembly  22.45 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189829  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  26.49 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3239  Fimbrial assembly family protein  23.9 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28.35 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0835  Fimbrial assembly family protein  26.06 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  22.89 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  26.75 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1515  fimbrial assembly family protein  28.82 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002323  type IV pilus biogenesis protein PilN  24.35 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0915694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  25.48 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06060  Tfp pilus assembly protein PilN  25.9 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2460  fimbrial assembly  24.21 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  26.26 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  26.21 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2974  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  25.77 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.815232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3134  fimbrial assembly  24.61 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1938  Fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.86 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  26.49 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00514  type IV pilus biogenesis protein PilN  23.42 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0203  type IV pilus assembly protein PilN  25.56 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2717  fimbrial assembly protein PilN  24.04 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0326  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  24.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  24.84 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0959  Tfp pilus assembly protein PilN  22.76 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0990  Tfp pilus assembly protein PilN  22.76 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2756  fimbrial assembly family protein  21.09 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02354  fimbrial assembly membrane protein  24.53 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.699012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2407  Fimbrial assembly family protein  22.95 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3024  Fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2210  putative fimbrial assembly protein PilN  24.56 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0329784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  22.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3252  Fimbrial assembly family protein  26.92 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0384  fimbrial assembly family protein  24.52 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45290  Fimbrial assembly protein  24.67 
 
 		 219 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3112  fimbrial assembly protein  24.48 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.230305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>