33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2202 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2202  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1983  Fimbrial assembly family protein  40.33 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00407145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0676  Fimbrial assembly family protein  27.07 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06060  Tfp pilus assembly protein PilN  27.72 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0642  fimbrial assembly  25.53 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0538  fimbrial assembly family protein  28.21 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714619  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0676  Fimbrial assembly family protein  25.82 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2137  Tfp pilus assembly protein, PilN-like  24.08 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000790236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5580  fimbrial assembly family protein  29.09 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0972  fimbrial assembly  28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.819185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  29.19 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0997  fimbrial assembly family protein  31.06 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1141  Fimbrial assembly family protein  24.87 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0993  fimbrial assembly family protein  25.49 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0731  fimbrial assembly family protein  28.12 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0700  Fimbrial assembly family protein  28.75 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0021  fimbrial assembly family protein  27.1 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  27.95 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3271  fimbrial assembly  24.02 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0782  fimbrial assembly  26.74 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4206  fimbrial assembly family protein  24.75 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4088  fimbrial assembly family protein  24.75 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3406  fimbrial assembly family protein  25.76 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0681762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5780  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  27.88 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4117  fimbrial assembly family protein  24.75 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0926405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1032  Fimbrial assembly family protein  22.78 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.457763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0827  fimbrial assembly family protein  22.56 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.839897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66650  type 4 fimbrial biogenesis protein PilN  28.57 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.766232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0332  fimbrial assembly family protein  16.67 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.455084  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4007  Fimbrial assembly family protein  24.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1678  Fimbrial assembly family protein  24.4 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0211  fimbrial assembly  26.47 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.479471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>