48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2766 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2766  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 163 aa  314  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  40.4 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  33.96 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  37.75 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3419  peptidase A24A, prepilin type IV  36.24 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  43.3 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  35.9 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  35.76 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  36.13 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  36.73 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  33.74 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3004  peptidase A24A prepilin type IV  35.86 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  34.69 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  31.82 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0303  peptidase A24A, prepilin type IV  35.76 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  34.67 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  32.69 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  38.12 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  39.82 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2059  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.158633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1121  peptidase A24A prepilin type IV  32.61 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  0.89566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4198  peptidase A24A prepilin type IV  43.01 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  35.53 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4094  peptidase A24A, prepilin type IV  32.24 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  36.67 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  29.14 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  29.7 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0304  peptidase A24A prepilin type IV  28.66 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0823  putative fimbriae assembly-related protein  32.86 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0431004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0338  putative fimbriae assembly-related protein  32.86 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1682  A24 family peptidase  32.86 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  31.25 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3791  peptidase A24A prepilin type IV  29.61 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1883  peptidase A24A, prepilin type IV  31.54 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0231  peptidase A24A prepilin type IV  38.14 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2461  CpaA2 pilus assembly protein, putative  29.58 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  30.36 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  26.58 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2701  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  30.41 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  30.26 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  28 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  30.49 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  37.11 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  29.66 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0893  peptidase A24A prepilin type IV  33.94 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>