123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2716 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0290  glycyl aminopeptidase  53.18 
 
 		 650 aa  703    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2716  peptidase M61  100 
 
 		 693 aa  1413    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3986  peptidase M61 domain-containing protein  49.23 
 
 		 644 aa  621  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0105  peptidase M61 domain-containing protein  50.73 
 
 		 642 aa  617  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.953091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00005  PDZ domain family protein  49.59 
 
 		 626 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0685  peptidase M61 domain protein  45.93 
 
 		 660 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1128  peptidase M61 domain protein  48.36 
 
 		 627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2029  peptidase M61 domain protein  46.83 
 
 		 632 aa  542  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4442  glycyl aminopeptidase  40.77 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4782  peptidase M61 domain-containing protein  45.18 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1119  peptidase M61 domain-containing protein  46.46 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2252  peptidase M61 domain protein  40.23 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.205983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2163  peptidase M61 domain protein  40.34 
 
 		 623 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1693  glycyl aminopeptidase  40.85 
 
 		 622 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.887266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  30.86 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  28.73 
 
 		 601 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  27.35 
 
 		 618 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  25.66 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  26.3 
 
 		 600 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  27.78 
 
 		 594 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  24.77 
 
 		 587 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  24.48 
 
 		 591 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  23.54 
 
 		 601 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  24.47 
 
 		 594 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  23.83 
 
 		 601 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  26.64 
 
 		 584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  25.13 
 
 		 603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  26.68 
 
 		 596 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  24.96 
 
 		 603 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  25.53 
 
 		 601 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  24.83 
 
 		 605 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  24.05 
 
 		 598 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  22.9 
 
 		 608 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  23.66 
 
 		 624 aa  107  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  27.54 
 
 		 601 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  24.86 
 
 		 605 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  27.54 
 
 		 601 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  28.7 
 
 		 596 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  28.48 
 
 		 596 aa  104  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  23.95 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  24.16 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  27.31 
 
 		 641 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  24.9 
 
 		 597 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  23.68 
 
 		 585 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  23.01 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  24.83 
 
 		 600 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  25.25 
 
 		 597 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  26.67 
 
 		 599 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  27.25 
 
 		 599 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  22.32 
 
 		 616 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  23.5 
 
 		 603 aa  99.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  25.86 
 
 		 593 aa  99  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  26.44 
 
 		 622 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  26.38 
 
 		 592 aa  98.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  26.34 
 
 		 600 aa  97.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  28.62 
 
 		 590 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  25.86 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  26.3 
 
 		 612 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  25.66 
 
 		 599 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  25.66 
 
 		 599 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  26.3 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  26.3 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  23.22 
 
 		 598 aa  95.5  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  27.42 
 
 		 585 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  26.59 
 
 		 609 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  26.59 
 
 		 609 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  26.59 
 
 		 609 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  26.59 
 
 		 609 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  25.94 
 
 		 599 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  25.12 
 
 		 615 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  25.06 
 
 		 590 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  25.95 
 
 		 584 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  26.03 
 
 		 588 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  25.55 
 
 		 600 aa  91.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  22.35 
 
 		 610 aa  91.3  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  24.24 
 
 		 689 aa  90.5  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  25.73 
 
 		 588 aa  90.5  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  27.67 
 
 		 612 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  25.44 
 
 		 578 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  25.7 
 
 		 584 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  28.66 
 
 		 614 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  25.48 
 
 		 588 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  25.72 
 
 		 571 aa  88.2  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  26.73 
 
 		 602 aa  88.2  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  26.11 
 
 		 588 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  25.28 
 
 		 587 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  27.05 
 
 		 594 aa  86.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  25.63 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0311  peptidase M61  24.51 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.609176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  24.84 
 
 		 592 aa  86.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  24.73 
 
 		 613 aa  85.5  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  25.6 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  26.86 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  24.82 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  25.74 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  26.04 
 
 		 588 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  25.28 
 
 		 604 aa  83.2  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  25.37 
 
 		 588 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  22.43 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  26.5 
 
 		 661 aa  81.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>