142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2100 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  41.72 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  34.97 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  41.08 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  46.95 
 
 		 163 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  41.22 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  41.22 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  41.96 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  40.48 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  43.17 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.86 
 
 		 226 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  45.11 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  42.96 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  42.07 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  44.36 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  39.33 
 
 		 358 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  42.65 
 
 		 161 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  39.02 
 
 		 534 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  42.04 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  42.18 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  43.54 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  44.38 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  39.69 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  42.75 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  36.75 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.22 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  37.59 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  37.06 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  45.67 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.33 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  39.19 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  39.26 
 
 		 243 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  34.53 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  38.06 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.5 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  37.96 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.4 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  38.52 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  39.33 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  36.57 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.74 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  34.45 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  36.31 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.47 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  38.24 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.21 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.74 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  32.86 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  36.17 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  36.13 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.83 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.64 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  34.59 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  34.93 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  32.39 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.01 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.15 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.5 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.07 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  30.28 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.79 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.45 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  37.27 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  32.65 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  31.51 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.01 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  40.32 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  34.04 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  31.06 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  37.4 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  35.54 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  25.79 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.36 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  30.46 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  29.17 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.11 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.08 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  35.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  23.36 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.42 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  35.34 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.92 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.92 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  29.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  36.13 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.21 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  25.32 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  27.61 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.06 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.99 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>