57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0462 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  100 
 
 		 553 aa  1137    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  60.67 
 
 		 565 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  52.91 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  55.26 
 
 		 549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  54.25 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  54.37 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  52.2 
 
 		 560 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  53.22 
 
 		 574 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  53.22 
 
 		 574 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  52.74 
 
 		 573 aa  555  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  52.89 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  52.37 
 
 		 576 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  49.91 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  51.6 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  48.86 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  48.48 
 
 		 568 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  51.14 
 
 		 574 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  49.72 
 
 		 583 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  42.63 
 
 		 542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  28.78 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  26.55 
 
 		 504 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  27.29 
 
 		 484 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  25.17 
 
 		 542 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  25.56 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  27.32 
 
 		 519 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  28.16 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  25.44 
 
 		 493 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  25.48 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  27.19 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  26.36 
 
 		 493 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  25.05 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  27.2 
 
 		 528 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  25.18 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  25 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  25.05 
 
 		 525 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  23.34 
 
 		 517 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  22.74 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  22.85 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  24.8 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  24.8 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  23.66 
 
 		 541 aa  73.9  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  23.61 
 
 		 390 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  22.66 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  22.69 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  24.32 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  23.75 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  22.17 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  22.82 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  19.91 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3271  hypothetical protein  38.37 
 
 		 110 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  23.06 
 
 		 404 aa  50.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  22.3 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  21.62 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  22.05 
 
 		 397 aa  48.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3124  cytochrome c, mono- and diheme variants  29.63 
 
 		 121 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.412627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4222  c-type cytochrome c55x  32.35 
 
 		 123 aa  47.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  33.78 
 
 		 110 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>